Unter Neueste (Verlauf) sowie unter Gelöschte Dateien (Papierkorb) waren Daten vorhanden. Auch die Speicherbelegung zeigte mir, das Daten vorhanden sind. Am Browser Firefox lag es nicht, da ich mit Chromium und Brave das selbe Problem hatte.
In der Android NextCloud App, waren alle Ordner sichtbar. Auch die externen Speicher sind nicht davon betroffen, weder in der App noch im Browser.
Sowas hab ich auch. Klick oben rechts auf die 4 Quadrate um von der Listenansicht auf die Rasteransicht umzuschalten. Da sind auf einmal meine Dateien wieder da. Ich sehe nur halbe Ordner.